如何判断一个芯片结果的好坏?
发布日期:2020-03-04
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从图象来看，主要看有无划痕，有无图象缺失，图象是否清晰，背景是否过高, .点是否规则，大小是否均-，有无融点，拖尾等现象，图象均一-性如何，是否存在边缘不清晰，阳性及阴性内参的情况等。
从数据来看: (1) 检出率是否异常: (2)重复性如何(相关系数); (3)变异系数(CV值): (4)与qPCR趋势的吻合程度: (5)技术重复中差异基因的重复程度等。
补充:有无划痕或有无图像缺失，各个生产厂商有不同的界定。因为和所有的工业产品一样，芯片在制造的过程中不可避免会产生瑕疵。为了避免对杂交后数据的影响，数据的芯片在设计的时候已经考忠到了数据冗余量，小而积的数
据点丧失不会对芯片数据造成影响，如: Affymetrix 芯片能耐受的瑕疵区域而积是不超过芯片面积的2.5%。
据点丧失不会对芯片数据造成影响，如: Affymetrix 芯片能耐受的瑕疵区域而积是不超过芯片面积的2.5%。
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